'Kamu görevlisine karşı kemik kırığı oluşturacak şekilde yaralanmasına sebep olmak' suçundan hakkında dava açılan Şahin Şimşek, yaklaşık üç ay Kayseri Kapalı Cezaevinde tutuklu kaldıktan sonra ilk duruşmasına çıktı. Kayseri 3. Asliye Ceza Mahkemesi'nde görülen duruşmaya Enerji ve Tabii Kaynaklar Bakanı Taner Yıldız katılmadı. Bakan Yıldız'ın avukatları Kayseri Baro Başkanı Ali Aydın, Mehmet Savruk, Kubilay Gürcan, Hamdi Öksüzkaya ve Aynur Küçükle birlikte tutuklu sanık Şahin Şimşek, avukatları Sümer Erol, Savaş Kaya ve İlhami Şimşek duruşmada hazır bulundu.
Mahkemedeki savunmasında göz yaşları içerisinde Bakan Taner Yıldız'a gerçekleştirdiği yumruklu saldırıdan dolayı çok üzgün ve pişman olduğunu dile getiren Şimşek, verdiği ilk ifadesini onayladığını ve Bakan Yıldız'dan özür dilediğini söyledi. Beden öğretmeni olduğunu ve gerçekleştirdiği eylemin kendisine yakışmadığını itiraf eden Şimşek, "Ben hastayım. İlaçlarımı alamadığım zaman normal bir insanın sergilediği davranış ve tutumları sergileyemiyorum. Şehit Levent Çetinkaya benim hem arkadaşım hem de bir öğrencimin akrabasıdır. Bu öğrencim cenazeye gitmek için benden izin istedi. Bende izin veremeyeceğimi okul idaresiyle görüşmesi gerektiğini söyledi. İlk 4 saati normal bir şekilde dersimi işledim. 5. Saatte tüm öğrencilerin şehit cenazesine gittiğini öğrendim ve öğrencilere bakarak tekrar okula getirmek için bende şehitliğe gittim. Burada bazı insanların 'ne biçim insanlarsınız hiç tepki göstermiyorsunuz, bu adam buraya hangi yüzle gelmiş' gibi ortamı geren ve provokasyona neden olabilecek söylemlerde bulunuyorlardı. Bakan Yıldız'da şehidin yakınlarıyla konuşurken yüz mimiklerinden çok donuk ve ilgisiz gibi duruyordu. Bende hem hastalığımın neden olduğu etki hem de Bakanın bu tutumundan dolayı tabutun üzerine ayağımla basarak istemeden kendimi Bakan Yıldız'ın üzerine attım. Ama bu yaptığım olaydan dolayı çok üzgün ve pişmanım. Çok özür diliyorum." diyerek kendisini savundu.
Enerji ve Tabii Kaynaklar Bakanı Taner Yıldız 'ın avukatlarından Mehmet Savruk, müvekkilinin ifadesinin talimatla Ankara'da alınacağını belirtti. Mahkeme başkanı sanık ve avukatları dinledikten sonra Şahin Şimşek'in alacağı cezayı dikkate alarak tahliyesine karar verdi.
19 Nisan 2010 tarihinde Kayseri'de şehit Kıdemli Yüzbaşı Levent Çetinkaya'nın cenaze törenine katılmak için Kayseri'ye gelen Bakan Yıldız, Kartal Endüstri Meslek Lisesi'nde beden eğitimi öğretmeni olarak görev yapan Şahin Şimşek'in yumrukla saldırısına maruz kalmıştı. Şahin Şimşek, bu olay sonrasında çıkarıldığı ilk mahkemede tutuklanarak ceza evine gönderilmişti. Oğlunun duruşmasını takip etmek için adliyeye gelen Şahin Şimşek'in annesi Ayşe Öz'de tahliye kararına çok sevindiğini belirterek, hem kendi hem de oğulları adına Bakan Taner Yıldız dan çok özür dilediklerini söyledi. Ellerinden geleni yaptıklarını kaydeden anne Öz, oğlunun kurtulmasından dolayı çok mutlu olduklarını dile getirdi. Şahin Şimşek'in eşi çocukları ve diğer yakınları da adliyeye gelerek duruşmayı takip etti.