Başbakan Abdullah Gül, 14 Mart 2003'te görevi Erdoğan'a devredip Başbakan Yardımcısı ve Dışişleri Bakanlığı görevini üstlendi.Gül hükümetinin Devlet Bakanı ve Başbakan Yardımcısı Ertuğrul Yalçınbayır, Dışişleri Bakanı Yaşar Yakış ve Çevre Bakanı İmdat Sütlüoğlu, Tayyip Erdoğan'ın başkanlığında kurulan kabinenin dışnda kaldılar.Kültür Bakanlığı ile Turizm Bakanlığı, TBMM'de 16 Nisan 2003'te kabul edilen yasa ile birleştirilerek, "Kültür ve Turizm Bakanlığı" adını aldı.

Aynı gün, Turizm Bakanı Erkan Mumcu, Kültür ve Turizm Bakanlığı'na, Turizm Bakanı Güldal Akşit de, kadından sorumlu Devlet Bakanlığı'na getirildi.Çevre Bakanlığı ile Orman Bakanlığı, 8 Mayıs 2003 tarihinde birleştirilerek, "Çevre ve Orman Bakanlığı" adını aldı. Orman Bakanı Osman Pepe Çevre ve Orman Bakanlığı'na atanırken, Çevre Bakanı Kürşat Tüzmen, Devlet Bakanlığı'na getirildi.2 Haziran 2005'te yapılan ikinci revizyonda ise Güldal Akşit Kadın ve Aileden Sorumlu Devlet Bakanlığı görevini Nimet Çubukçu'ya(Baş) bıraktı.Tarım ve Köyişleri Bakanı Sami Güçlü de yerini Mehdi Eker'e bıraktı. Zeki Ergezen ise Bayındırlık ve İskan Bakanlığı görevini Faruk Nafiz Özak'a devretti.

22 Temmuz 2007 seçimlerinin ardından kurulan 60'ıncı Hükümet'te de bir önceki Hükümet'e göre önemli değişiklikler yaşandı. 2 Mayıs 2009'daki revizyonla 8 bakan kabine dışında kaldı, 7 bakanın görev yeri değişti.Nazım Ekren, Said Yazıcıoğlu, Kürşad Tüzmen, Kemal Unakıtan, Hüseyin Çelik, Mehmet Ali Şahin ve Hilmi Güler bu revizyonda Bakanlar Kurulu'ndan ayrılan isimler oldu.Ocak 2009'da Egemen Bağış Başmüzakereci ve Devlet Bakanı sıfatıyla Bakanlar Kurulu'na katıldı.

12 Haziran 2011 seçimlerinin ardından 6 Temmuz 2011'de kurulan 61. Hükümet'te, aralarında Bekir Bozdağ, Fatma Şahin, İdris Naim Şahin, Erdoğan Bayraktar, İsmet Yılmaz ve Suat Kılıç ilk kez görev alırken, 19 eski bakan yerini korudu.Bekir Bozdağ Başbakan Yardımcısı, Fatma Şahin Aile ve Sosyal Politikalar Bakanı, İdris Naim Şahin İçişleri Bakanı, Erdoğan Bayraktar Çevre ve Şehircilik Bakanı, Suat Kılıç Gençlik ve Spor Bakanı ve İsmet Yılmaz Milli Savunma Bakanı oldu.AK Parti Hükümetlerinde Meclis dışından Hükümet üyesi olan tek isim ise Ahmet Davutoğlu oldu.

Davutoğlu, Dışişleri Bakanı olduktan yaklaşık 2 yıl sonra yapılan 2011 seçimlerinde milletvekili seçildi.Beşir Atalay, Ali Babacan, Recep Akdağ ve Binali Yıldırım tüm hükümetlerde görev yaptı. Son değişiklikle Akdağ, Sağlık Bakanlığı görevinden ayrıldı.Ali Babacan ve Beşir Atalay, kabine içinde görev değişikliği yaşarken, Ulaştırma, Denizcilik ve Haberleşme Bakanı Binali Yıldırım ise Seçim Kanunu'ndan kaynaklı olarak seçim süreçlerindeki zorunlu ayrılığın dışında görevine devam etti.

8 Mart 2011 tarihinde Anayasası’nın 114'üncü maddesi gereğince, 12 Haziran 2011 Türkiye genel seçimleri öncesi İçişleri Bakanlığı'na müsteşar Osman Güneş, Adalet Bakanlığı'na müsteşar Ahmet Kahraman ve Ulaştırma Bakanlığı'na müsteşar Habip Soluk atandı.

AK Parti iktidarları boyunca bakanlık yapanların sayısı 24 Ocak 2013'te göreve getirilen Ömer Çelik, Nabi Avcı, Muammer Güler ve Mehmet Müezzinoğlu ile 57'ye çıktı.Son revizyonla, Milli Eğitim Bakanlığı'na Ömer Dinçer'in yerine Nabi Avcı, Sağlık Bakanlığı'na Recep Akdağ'ın yerine Mehmet Müezzinoğlu, Kültür ve Turizm Bakanlığı'na Ertuğrul Günay'ın yerine Ömer Çelik ve İçişleri Bakanlığı'na İdris Naim Şahin'in yerine Muammer Güler atandı.